home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00318 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.6 KB  |  52 lines
  1. ******************************************************
  2. * PTS HPr component phosphorylation sites signatures *
  3. ******************************************************
  4.  
  5. The phosphoenolpyruvate-dependent sugar  phosphotransferase system (PTS) [1,2]
  6. is a major carbohydrate  transport system in bacteria.   The PTS catalyzes the
  7. phosphorylation  of  incoming   sugar   substrates   concomitant   with  their
  8. translocation across the cell membrane.  The  general  mechanism of the PTS is
  9. as follows: a phosphoryl group from  phosphoenolpyruvate (PEP)  is transferred
  10. to Enzyme I (EI) of the PTS which in turn transfers it to a phosphoryl carrier
  11. protein (HPr).  Phospho-HPr  then  transfers  the phosphoryl group to a sugar-
  12. specific permease complex (enzymes EII/EIII).
  13.  
  14. HPr [3 to 5] is a small cytoplasmic protein of 70  to  90 amino acid residues.
  15. In some bacteria HPr is a domain in a larger protein that includes a EIII(Fru)
  16. (IIA) domain and in some cases also the EI domain.    A conserved histidine in
  17. the N-terminal section of HPr serves as  an acceptor for  the phosphoryl group
  18. of EI.  In the central part of HPr there is a conserved serine which, in gram-
  19. positive bacteria only, is phosphorylated by  an ATP-dependent protein kinase;
  20. a process which probably play a regulatory role in sugar transport.
  21.  
  22. The sequence around both phosphorylation sites are well conserved  and can  be
  23. used as signature patterns for HPr proteins or domains.
  24.  
  25. -Consensus pattern: G-[LIVM]-H-[STA]-R-[PA]-[GSTA](2)
  26.                     [H is phosphorylated]
  27. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  28. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  29.  
  30. -Consensus pattern: [GA]-[KR]-x(4)-[KR]-S-[LIVMF](2)-x-[LIVM]-x(2)-[LIVM]-[GA]
  31.                     [S is phosphorylated]
  32. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  33. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: Escherichia coli  glycogen synthase
  34.  and human polyposis locus protein 1.
  35.  
  36. -Expert(s) to contact by email: Reizer J.
  37.                                 jreizer@ucsd.edu
  38.  
  39. -Last update: June 1994 / Text revised.
  40.  
  41. [ 1] Postma P.W., Lengeler J.W., Jacobson G.R.
  42.      Microbiol. Rev. 57:543-594(1993).
  43. [ 2] Meadow N.D., Fox D.K., Roseman S.
  44.      Annu. Rev. Biochem. 59:497-542(1990).
  45. [ 3] Reizer J., Saier M.H. Jr., Deutscher J., Grenier F., Thompson J.,
  46.      Hengstenberg W.
  47.      CRC Crit. Rev. Microbiol. 15:297-338(1988).
  48. [ 4] Herzberg O., Reddy P., Sutrina S., Saier M.H. Jr., Reizer J., Kapadia G.
  49.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89:2499-2503(1992).
  50. [ 5] Reizer J., Hoischen C., Reizer A., Pham T.N., Saier M.H. Jr.
  51.      Protein Sci. 2:506-521(1993).
  52.